Ve městě také najdeme nejlépe dochovanou středověkou synagogu v Portugalsku. Byla postavena okolo roku 1430 a je pozoruhodná valenou klenbou na čtyřech pilířích. Bohoslužby se zde naposledy konaly roku 1497. Po vypovězení Židů ze země sloužila jako vězení, seník a sklad. Dnes zde sídlí malé židovské muzeum Museum Luso-Hebraico de Abraham Zacuto. Nese jméno významného portugalského astronoma a matematika 15. století. Další místní významnou sakrální stavbou je gotický kostel Santa Maria do Olival ze 13. století, jež byl postaven jako pohřebiště templářských rytířů. V průběhu staletí byl několikrát zrestaurován, zachoval si však gotické průčelí a rozetové okno. Je zde pohřben velmistr Gualdimo Paise a další templářští mistři. Kostel svým významem daleko přesahoval Tomar - ve věku objevů byl mateřským stánkem námořníků.

Místní kostel Sao Joao Baptista je zase pozoruhodným překrásným manuelským portálem a osmibokou věží. Uvnitř je zdobená kamenná kazatelna a vynikající obrazy ze 16.století, např. Poslední večeře a Stětí Jana Křtitele od Gregória Lopese (1490 - 1550). Naproti kostelu stojí radnice ze 17. století a pomník Gualdima Paise, zakladatele kláštera. V Tomaru také najdeme jednu z nejkrásnějších renesančních staveb Portugalska, kterou je kaple Nossa Senhora da Conceiçao postavená v letech 1532 až 1540 v čistě renesančním slohu a byla zamýšlena jako hrobka krále Jana III.